出身小学校について公表はしていませんが、ネット上には複数の在籍情報が見つかりました。

父親は店を経営しており、母親も働いていたため、幼少期は1人でいることが多く、レゴで遊ぶのが好きだったそうです。

時期は不明ですが、子供の頃に両親が離婚をしており、小学校時代は母子家庭で育ったようです。

1994年、実母の勧めで4歳の頃から児童劇団のアクターズスタジオつくば校 に所属し、1997年にNHKの連続テレビ小説『あぐり』で子役としてデビューを果たしました。

母親が三浦春馬を劇団に入れたのは、俳優にさせようとしたのではなく、一緒に遊んでくれる友達を探すためだったそうです。

小学校6年生だった2002年には、『森の学校』で映画初主演を果たします。同作品の西垣吉春監督は、三浦春馬の地元である土浦（茨城県）で「天才的な子役がいる」との噂を聞きつけ、当時小学校5年生だった三浦春馬に直接会ったところ、その魅力に惹かれ、撮影前から「春馬くんを主役に」と決めていたそうです。

子役として活躍する一方で、小学校時代はサッカーに熱中していたそうです。

中学2年生からサッカー部に所属しており、当時から運動神経抜群の少年でした。

小学校時代に引き続き中学時代もアクターズスタジオつくば校に通学し、演技を学んでいました。

アクターズスタジオ時代には、松永一哉、鈴木和也とともにダンスチーム「Brash Brats」を結成し、ボーカルを担当していました。路上ライブなども行っていたようですが、中学3年生だった2005年に活動を休止しています。

中学時代に母親が再婚して、苗字が「笹本」に変わりました。中学時代はヤンチャだったようで、友達と夜中に学校のプールで泳いだこともあるそうです。

中学2年生だった2004年に、アミューズに所属することになりました。その後も、『連続テレビ小説「ファイト」』や『いま、会いにゆきます』、『アンフェア』など、ドラマを中心に順調にキャリアを重ねていきました。

中学時代は仕事が忙しく、勉強も嫌いだったため、高校に進学しないで俳優業に専念しようと考えていたそうですが、最終的には進学を選びました。当初は親元を離れて堀越高校に通うことを母親に反対されていましたが、それを押し切る形で堀越高校に入学しました。

堀越高校の同級生には、女優の蓮佛美沙子や福田沙紀、Hey! Say! JUMPの八乙女光などがいます。